Впервые за всю историю серии появился женский футбол. В FIFA 16 доступны женские национальные сборные Германии, США, Франции, Швеции, Англии, Бразилии, Канады, Австралии, Испании, Китая, Италии и Мексики. Играть женские команды могут только между собой в режиме Матч дня, в офлайн турнирах и онлайн товарищеских матчах. Для футболисток были записаны новые анимации бега, лица и волос. Также в игре появились эксклюзивные движения и игровые стили таких футболисток как Кристина Синклер (Канада), Алекс Морган и Стефани Хьютон . В FIFA 16 произошли небольшие улучшения графики: в игре сделали новые текстуры кожи, продолжили эксперименты со светом, улучшили освещение в вечернее время и погоду — появился лёгкий туман.
